El Museo La Merced, se ubica en el edificio contiguo a la Basílica del mismo nombre, declarada monumento nacional en el año 1977 junto a sus edificaciones aledañas. Este monumento de la calle Mac-Iver, cobija desde el año 1873 las colecciones que forman parte de su actual patrimonio. Su fundador el padre Benjamín Rencoret, con su espíritu visionario y sensibilidad por el arte de nuestros países americanos, sin saberlo, comienza a formar una de las colecciones mas importantes del país.

Su obra fue continuada en 1919 por el padre Miguel Ríos y el hermano Flaminio Ruiz, entomólogo, quienes con mucho celo, enriquecieron esta valiosa colección de arte. En el Museo se pueden apreciar dos grandes secciones, una de arte religioso y otra de arqueología Pascuense y americana.

El arte religioso de este Museo cuenta con pinturas, imaginería y orfebrería, de los siglos XVII, XVIII y primera mitad del siglo XIX, provenientes en su mayoría de las escuelas quiteña, cuzqueña y alto peruana.

Su actual director es el Padre Edgardo Arriagada Figueroa O. de M.